本发明公开了一种基于高阶网络的海运数据生物入侵可视化方法及系统，该方法包括：获取海运数据并根据海运数据生成港口之间的生物入侵概率；基于港口之间的生物入侵概率，结合海运数据构建生物入侵高阶网络；基于生物入侵高阶网络生成港口入侵风险，并进行可视化展示。该系统包括：概率计算模块、网络构建模块和展示模块，通过使用本发明，能够利用海运数据构建高阶网络，并有效展示高阶网络的各项数据，从而更好地进行生物入侵可视化分析。本发明作为一种基于高阶网络的海运数据生物入侵可视化方法及系统，可广泛应用于生物入侵预测领域。