本发明公开了一种基于暴露特征、毒性通路和生物标志的食品安全风险评估程序和框架体系构建方法，包括：步骤1，从时间维度和空间维度对二噁英进行膳食暴露概率评估；步骤2，基于膳食暴露概率估计结果，选择CTE场景和RME场景进行致癌风险评估；步骤3，基于致癌风险评估的评估结果，进行疾病负担估计得到剂量依据；步骤4，选用2,3,7,8‑TCDD作为研究对象，通过CTD筛选靶器官及其相关基因，进行通路富集分析，筛选出NRF2/KEAP1信号通路；步骤5，选用2,3,7,8‑TCDD作为研究对象，基于剂量依据，按照NRF2/KEAP1信号通路作为验证的目标通路进行通路验证，探究毒性通路扰动剂量；步骤6，将毒性通路扰动剂量作为食品安全风险评估框架体系的基础数据，构建食品安全风险评估框架体系。