本发明提供了一种高效小麦育种装置，该育种装置包括育种箱体，顶部通过带阀门的输送管与浸种箱连通，底部侧壁上设有带滤网的排液管；小麦催芽机构，设在输送管出口下方的育种箱体内，包括顶部敞口的圆筒形框架以及覆盖在圆筒形框架内壁上的第一棉纱布，圆筒形框架的顶部设有能够绕圆筒形框架内顶壁旋转一周的遮蔽组件，用于将圆筒形框架的顶部敞口密封；旋转机构，包括步进电机、第一横杆和第二横杆，步进电机设在育种箱体外，且步进电机的输出轴通过第一横杆与圆筒形框架的外壁固定连接，第二横杆的一端与育种箱体内壁转动连接，第二横杆的另一端与圆筒形框架的外壁固定连接，步进电机通过第一控制开关与电源电连接。本发明提高了育种效率。