本发明公开了一种真空激光透射镜片保护系统及方法，本系统包括激光透射模块、滑动密封模块和防飞溅模块，激光透射模块作为激光从系统外部射入通道固定于滑动密封模块上，滑动密封模块驱动激光透射模块在垂直激光入射方向的平面内滑动，防飞溅模块固定于滑动密封模块底部，用于引导气流，避免焊接飞溅及烟尘污染透射单元模块，激光透射模块包括密封镜筒、保护镜筒和可替换镜筒，可替换镜筒竖直固定于滑动密封模块上，可替换镜筒包括进气口，通过外接气源通入气体在可替换镜筒内形成正压，保护镜筒固定安装于可替换镜筒顶部，密封镜筒固定安装于保护镜筒的顶部，其内设有冷却水道，解决了光学镜片容易受热变形、镀膜损伤和维护不便的问题。