本发明适用于绩效管理技术领域，提供了一种综合医院健康管理中心绩效考核管理系统，系统包括：管理项目分值库，包含所有健康管理项目和每一个健康管理项目对应的项目分值；人员管理模块，用于存储健康工作人员的基本信息；数据管理模块，用于接收健康工作人员的上班时间和下班时间，得到健康工作人员的正常工作时长和加班时长；健康项目管理模块，用于接收健康工作人员上传的每项健康管理项目的完成数量，根据每项健康管理项目的完成数量和项目分值得到工作积分；以及绩效统计模块，根据基本信息、工作积分、正常工作时长和加班时长得到员工绩效。员工绩效考核全面、效率高，且主要与工作积分呈正相关，能够调动健康工作人员的工作积极性。