本发明公开了一种隔离区域分体式空调冷凝水消毒装置，包括：冷凝水盒，且冷凝水盒的一端设置有冷凝水管，且冷凝水盒的另一端设置有驱动机构，且冷凝水盒的内侧设置有消毒剂喷淋管，且消毒剂喷淋管上端的中间设置有消毒剂进管；电极加热机构，且电极加热机构内部下端的一侧设置有第一电极，且电极加热机构内部下端的另一侧设置有第二电极，且电极加热机构内部的中间设置有中心进水管，且电极加热机构上端的一侧设置有液位传感器；消毒机构，且消毒机构内部的上端设置有上隔板，且消毒机构内部的下端设置有下隔板。其实现了对感染性废水的自动消毒作用，从而有效的避免了人工消毒存在的高成本和感染风险的问题。