本发明涉及一种过滤器清洗系统，所述过滤器清洗系统包括：清洗罐模块，管道模块，离心泵，供水模块，清洗剂模块，排放模块，所述清洗罐模块设有第一入口与第一出口；所述离心泵设置于所述第一管道上，且所述离心泵连通于所述清洗剂模块与所述第二管道之间；所述供水模块与所述第一入口连通，所述排放模块包括第一排放管，所述第一排放管与所述第一管道连通，其中，每一个部件与管道、管道与管道的连接处均设有阀门。本过滤器清洗系统，能够实现对过滤器的自动清洗，实现清洗过程的数据可查询、打印和追溯，有利于提高清洗效率，同时还有利于克服人工参与较多，易产生污染的问题，降低过滤器的污染风险，提高过滤器的清洗品质。