本发明公开了一种水上温室大棚耦合光伏种植养殖系统及方法，系统包括用于设置于水上的水面基础平台，水面基础平台上设置有温室大棚；温室大棚内设置有用于种植作物的种植设施，以及温湿度监控模块、人工补光灯和空调系统；水面基础平台之下设置有平台下补光灯，温室大棚顶部设置有光伏发电板，光伏发电板的电能分别用于向人工补光灯、空调系统和平台下补光灯供电，多余电量供给区域电网。本发明充分利用水域面积和鱼塘水面面积，开展温室现代设施农业+光伏的创新开发模式，降低了用地成本，增加了项目收入，不但可以解决用地成本高的问题，而且可以增加可再生能源发电份额，为区域的碳减排和现代农业转型做出贡献。