本发明公开了一种消化科胃部医疗信息处理方法及系统，涉及医疗信息处理领域，其中，所述方法包括：根据第一用户基本信息，调取第一检查数据；获得第一预设筛选指标；获得第一筛选特征；基于所述第一筛选特征对所述第一影像信息进行主成分分析，获得第一筛选影像；对所述第一主诉信息进行聚类分析，获得第一聚类结果；基于所述第一聚类结果，遍历所述第一筛选影像进行匹配，获得第一匹配结果；将所述第一匹配结果设为第一医疗信息进行上传。解决了现有技术中的针对消化科胃部医疗信息处理缺乏有效的前处理过程，输入的消化科胃部医疗信息冗杂性较强，进而造成消化科胃部医疗信息处理效果不佳的技术问题。