本发明公开了一种端对端加密的通信方法及系统，涉及互联网信息通信技术领域。所述方法包括：在可信环境下，获取第二终端的公钥key2与认证信息；第一密文信息发送至第二终端，以获取第二终端返回的access_token、对称密钥和相应对称加密算法；将access_token与第二密文信息发送至第二终端，以获取第二终端返回的第三密文信息；使用所述对称密钥和相应对称加密算法解密所述第三密文信息，得到所述数据响应信息。本发明在传输过程中基于对称加密算法实现双方数据安全传递，并在准备阶段预设了加密方案，从而消除了第三方以及数据传输平台从中间层截取数据包来获得用户数据的风险，数据安全得到双重保护。