本发明涉及自动控制领域，属于色谱柱的装填技术领域，且公开了微机控制全自动色谱柱装柱系统，包括色谱柱的自动装柱过程的三个阶段与系统单元，色谱柱的自动装柱过程的三个阶段分别为：恒压过程、横流过程、平衡过程，本系统的设计，能够提供一个完全自主装填色谱柱的设备方案，只要通过选择相对应装填的色谱柱程序，设备将自动完成装柱的整个过程，直到蜂鸣器响，取下装填完成的色谱柱，省时省力，单人能够同时操作3‑4台装填色谱柱设备，生产效率大大提高，并且没有人为的因素影响，质量稳定可靠，操作人员也不再需要特别培训，对人员要求大大降低，装填完成的色谱柱能够直接使用，不用再通过高压液相色谱的平衡换液。