生活饮用水微生物检测系统及检测方法，涉及微生物检测技术领域，为了解决在检测时需要在工作人员等待24小时后对微生物测试片的状态进行结果分析，若时间没有把握到位，其检测结果可能会存在误差，且操作较为繁琐的技术问题；本发明通过控制模块电性连接菌落总数判断模块，菌落总数判断模块电性连接中央处理器，中央处理器电性连接提示模块，菌落总数判断模块还电性连接大肠菌群判断模块，大肠菌群判断模块电性连接提示模块，提示灯电性连接单片机，单片机电性连接信号发出模块，信号发出模块无线连接信号接收模块，无需工作人员对微生物测试片的状态进行结果分析，操作简单，且解决了若时间没有把握到位，其检测结果可能会存在误差的问题。