本发明公开了一种基于植物染料的抗菌头巾及其制备方法，包括面料基层，所述面料基层的顶部设置有吸湿复合层，且吸湿复合层包括吸湿层与设置于吸湿层顶部的透气层，所述吸湿复合层的顶部设置有抗菌复合层，且抗菌复合层包括抗菌层。本发明通过设置的吸湿层能够将人体头部所排出的汗液进行快速的吸湿，使人体头部的表面能够保持干爽，避免额头的汗液滴落在眼睛处造成不适，设置的透气层能够在运动的过程中使头巾变得干爽，设置的抗菌层具有抗菌抑菌的作用，提高了头巾的抗菌性能，设置的防晒层将外界的紫外线与人体隔离开，有利于保护人们外出不受紫外线伤害，设置的耐磨层提高了面料的耐磨度，提高了面料的使用寿命。