本发明涉及干细胞保存技术领域，且公开了一种用于医学实验的干细胞样本长时间冷冻保存装置，包括箱体，所述箱体的外表面固定焊接有底板，所述底板的顶部固定安装有电机，所述电机的输出端固定套设有第一齿轮，所述箱体的外表面通过轴承旋转连接有转杆，所述箱体的顶部开设有进料口，所述进料口的内壁固定安装有导料管，所述导料管的内表面固定焊接有第一挡板。该用于医学实验的干细胞样本长时间冷冻保存装置，增加了高效筛选结构、吸取去尘结构和缓速降温结构，解决了干细胞在保存过程中损坏，且干细胞在初加工后会夹杂大量的杂物，而且保存装置内部并未设置温度平衡装置，当干细胞内部的温度与目标温度过高时，会导致干细胞损坏的问题。