本发明涉及海洋工程技术装备领域，旨在提供一种深渊水体双样品筒式保压取样系统。包括固定在固定架上的两个样品筒和一个取样驱动装置；样品筒由首尾相接的蓄能腔筒体和样品腔筒体组成，在样品筒的两端部，分别于蓄能腔筒体设插装式截止阀，样品腔筒体设进样水密接头；所述取样驱动装置由依次布置的电路腔、驱动器和电动取样阀组成，电路腔中设有控制电路模块，控制电路模块电连接至驱动器，由后者驱动电动取样阀执行动作；电动取样阀分别连接两个样品筒的进样水密接头和外部取样器。本发明能够实现多点位取样，满足单次下潜活动中更多采样点位的采样需求。独立且并列设置方式，让取样系统模块化运用具有可能性，具有灵活的使用机制。