本发明涉及机舱罩技术领域，尤其是一种模块化机舱罩的密封结构，包括骨架和安装在骨架上的若干机舱罩模块，所述机舱罩模块与骨架之间通过螺栓组件和螺母连接，所述机舱罩模块与骨架之间还设置有垫片，相邻机舱罩模块之间设置密封结构，所述密封结构包括密封型材和密封胶条，所述密封型材通过铆钉固定在骨架上，所述机舱罩模块安装后与密封型材之间形成导水槽，所述密封胶条位于密封型材和机舱罩模块之间；本发明中的模块化机舱罩的密封结构，采用铝合金密封型材，且通过铆钉安装在工字梁骨架上，型材与复材板接触面安装密封胶条防水，型材内部形成导水槽，采用双重防水结构，解决了传统机舱罩密封在更换部件时割除硅胶特别费工时的痛点。