本发明涉及一种医疗器械干燥设备，包括烘干箱以及供气装置，在烘干箱内安装有水平的主轴，在主轴两端与烘干箱内壁之间设置有旋转装置，通过旋转装置带动主轴绕其轴线转动或固定，在主轴上等间隔设置有若干的干燥轴，主轴与干燥轴内部均中空且连通设置，在干燥轴上还开设有若干的干燥孔，供气装置通过出气管和主轴一端的旋转装置连接；干燥时，打开烘干箱，控制主轴转动至干燥轴上端朝向烘干箱门板打开处，从而便于将针筒套设于干燥轴上，而后再控制主轴转动，直至干燥轴保持竖直，并同时启动供气装置，高温气体从干燥轴上的干燥孔喷出，实现对针筒内侧对的干燥，干燥完成后，打开烘干箱门，并通过控制主轴的转动，从而方便拿取针筒。