本申请公开了一种鞋底清洁消毒器，属于消毒装置领域，鞋底清洁消毒器，包括本体，本体的内部加工有消毒液腔体、凹槽、垫体容纳腔，所述垫体容纳腔与消毒液腔体之间设置有隔板，消毒液腔体与放置收集盒的凹槽之间设置有固定轴座体；固定轴座体上安装有固定轴，固定轴的两端通过转轴与本体连接，固定轴在转轴的带动下绕自身中心轴线转动；所述固定轴上安装有刮板，刮板在固定轴的长度方向上延伸；所述转轴在伸出本体的端部连接有踏板；消毒液腔体的内部设置有毛刷板，毛刷板上设置有供消毒液流过的若干通孔以及若干毛刷束。本申请能够对饲养人员的鞋底进行全方位消毒，避免小型饲养场或圈舍中因饲养人员流动于不同的饲养环境所造成的交叉传染。