本发明涉及一种基于微生物的污水除臭净化系统，涉及除臭净化技术领域。本发明通过在除臭箱中加入微生物除臭剂以对污水进行除臭净化处理，在除臭箱设置臭味检测仪和光传感器，以及通过设置控制单元，并通过控制单元的分析模块根据臭味检测仪检测的臭味浓度数值和透光率共同确定所述微生物除臭剂对污水的净化分解是否完成，并在判定未完成时，向除臭箱中增加除臭剂以加速除臭净化，通过除臭箱内设置pH检测仪和在分析模块设置预设pH值，并当分析模块判定除臭净化未完成、臭味浓度数值达标且透光率不达标时，根据除臭箱中的pH值与预设pH值的比对结果再次判定污水净化是否完成，提高了对除臭净化系统的控制精度，从而进一步提高了除臭净化效率。