本发明涉及地质勘探技术领域，具体为一种水文地质钻孔水位自动采集装置及方法，所述水位采集模块包括水位采集箱和数据传输模块，数据传输模块用于水位采集模块与中心采集上位机信息的交换，所述取水管的顶端外侧与水位采集箱的内侧相连通，所述取水管的数量至少为3个，所述取水管的底端高度和顶端高度均相等，在这种设置下，一方面能够通过三个位置的测量取均值来减小监测误差，一方面可以通过三个监测点水位采集箱内压强数据的对比来防止其中一个监测点水位采集箱出现密封问题，所述水位采集模块通过数据传输模块实现与中心采集上位机的信息互通，所述水位采集模块包括抽气泵、固定模块、水线信息模块、气压信息模块和气压补偿模块。