本发明公开了一种机械嫁接用苗木夹持机构，包括苗木支撑组件、切削夹紧组件和排苗夹紧组件，所述苗木支撑组件设有穗木动支座、穗木定支座、砧木动支座和砧木定支座，用于切削过程中砧木、穗木的定位、支撑；所述切削夹紧组件设有夹紧气缸、气缸座、夹具体、砧木压块和穗木压块，用于切削过程中砧木、穗木的夹紧；所述排苗夹紧组件设有排苗滑台、立柱、立柱安装座、压苗气缸、压苗气缸座、连接座、压苗块，用于排苗过程中嫁接苗的定位与夹紧。该机构可用于机械嫁接过程中砧木、穗木的定位与可靠夹持，辅助完成其切削、接合及排苗作业。