本发明实施例公开了一种磁悬浮轴承监测系统、方法、装置、电机设备及存储介质，应用于包括磁悬浮轴承的电机设备，在所述磁悬浮轴承的转子上设置位置传感器，所述系统包括：数据处理单元、AD转换器和存储单元；数据处理单元用于：按照预设时间间隔从所述AD转换器获取转子的位置信息；根据位置信息进行悬浮轨迹分析；根据悬浮轨迹分析的分析结果判断位置信息的存储模式；若悬浮轨迹分析的分析结果为正常状态，按照第一存储模式在存储单元存储位置信息；若悬浮轨迹分析的分析结果为异常状态，按照第二存储模式在存储单元存储位置信息。本申请的监测系统能够准确记录磁悬浮轴承发生故障前后的运行轨迹，有效提升磁悬浮轴承故障分析的效率。