本发明公开了一种生产小分子活性硒肽的原材料预处理设备，包括可移动的设置在环形轨道内的移动单元，移动单元下方转动设置有可升降的研磨单元，环形轨道下方有若干的浸泡单元，若干的浸泡单元相对于环形轨道的轴线圆形阵列，若干的浸泡单元下方有收集池；浸泡单元包括有可转动翻转的方形浸泡箱，方形浸泡箱内设置有可升降的液面抬升组件，液面抬升组件的抬升端可与研磨单元的研磨端相对应。本申请设置若干方形浸泡箱，对植物小分子肽的原材料进行浸泡，通过设置移动单元带动研磨单元依次进入若干的方形浸泡箱内，一个方形浸泡箱内进行研磨时，其余的方形浸泡箱内的植物原材料将会进行浸泡，保证了浸泡的时间，提升了植物原材料处理效率。