本发明公开了一种磁悬浮变频冷水机组，在满足减载条件时，获取每台运行压缩机的频率、压比、吸气导叶开度；如果同时满足：每台运行压缩机的压比在设定压比范围内、每台运行压缩机的吸气导叶开度≥设定开度阈值、每台运行压缩机的频率≤设定频率阈值；则关停一台运行的压缩机；如果没有同时满足：每台运行压缩机的压比在设定压比范围内、每台运行压缩机的吸气导叶开度≥设定开度阈值、每台运行压缩机的频率≤设定频率阈值；则控制每台运行压缩机降频或/和吸气导叶开度减小。本发明的磁悬浮变频冷水机组，既实现了冷水机组的节能，保证了冷水机组的可靠性，提高了节能效果及可靠性和稳定性，还实现了冷水机组的运行效率和能效的平衡控制。