本发明涉及分析仪器设备领域，尤其是一种独立式双风机液相色谱用柱温箱，其包括机壳和箱门，机壳内设置与箱门围合形成的封闭腔，封闭腔内设置内胆、色谱柱、风机、散热片及加热装置，所述内胆固定设置在封闭腔内，色谱柱与散热片分别设置在内胆两侧，加热装置设置在散热片远离色谱柱的一侧，风机设置在色谱柱与散热片之间，并驱动空气向散热片方向移动，内胆上设置通风孔。本发明通过上下设置的两个转速不同的风机，调整柱温箱上部和下部的散热效率不同，进而使柱温箱内放置色谱柱的腔室内温度均匀、一致；配合倾斜设置的通风孔，贴合空气由风机处排出时的流向，减小空气流通的风阻，同时提高气流流动时的紊乱程度，提高换热效率。