本发明提出了一种复杂结构数据自动加密解密方法及系统，涉及数据加密解密技术领域，针对现有技术中复杂数据的加密解密难点，整体通过一个通用的数据安全加解密框架，基于注解思想、通过拦截器统一拦截处理所有数据库操作映射方法的参数加密和结果解密。其中自动加密解密方法包括以下步骤：预设加密解密策略，并作为加密解密过程的执行依据；构建数据加解密处理器执行链；基于加密解密策略，根据需求调用数据加解密处理器执行链触发数据加密解密功能。加解密过程全部在框架内部实现，无需开发人员改写业务代码，实际应用中开发人员只需要引入本框架，做一些简单的配置即可使用，极大的减少了开发人员的代码修改量和后期维护成本。