本发明公开了一种基于大数据的智能微生物检测仪及其使用方法，包括有台座，台座的顶部两侧对称的设置有规格相同的滑动板，每个滑动板的内侧沿形成有一凹槽，该凹槽的内部一端转动安装有从动链轮，凹槽的内部另一端转动安装有主动链轮，第一驱动电机的电机轴穿过滑动板后与主动链轮的中心轴固定相连，从动链轮与主动链轮之间套接有链条，链条的工作面上等间距的分布有多个固定套，每个固定套的内部均固定套接有用于固定标本的固定钉，固定于两侧的固定钉上的标本随着链条的运动完成正反两面的检测。本发明可在不取下标本的情况下完成其正反两面的检测，从而节省了工作人员操作的麻烦，进而也提升了检测效率。