本申请公开一种水下地形的获取方法和系统，本方法包括：获取目标水域的水下地形的三维点云数据；对三维点云数据进行数据预处理和折射校正处理，得到真实点云数据；基于真实点云数据进行三维重建，得到水下地形三维模型；进而得到目标水域的水下地形数据。本系统包括水下图像采集设备、点云数据模块、三维模型模块和输出模块；图像采集设备获取目标水域的水下地形图像，并转换为三维点云数据；点云数据模块对三维点云数据进行数据预处理和折射校正处理，得到真实点云数据；三维模型模块进行三维重建，得到水下地形三维模型；输出模块基于水下地形三维模型，得到目标水域的水下地形数据。本申请可以对坝体溃决后的河床地形进行实时、连续的获取。