一种解决光学遮挡的手术导航装置及导航方法属于医疗器械技术领域，目的在于解决现有技术存在的跟踪光线受遮挡，导航系统丢失内窥镜和手术工具的空间位置信息，无法进行手术操作的问题。本发明的一种解决光学遮挡的手术导航装置包括：光学跟踪设备；组合装置，组合装置包括被动式跟踪刚体、内窥镜以及相机，被动式跟踪刚体刚性固定于内窥镜尾端上方，相机刚性固定于内窥镜尾端下方；支架；支架尾端固定于手术部位附近的手术台上；以及棋盘标定板；棋盘标定板刚性固定于支架顶端。本发明在少量地增加了手术导航系统成本与复杂性的基础上，达到了保持跟踪信息的连续性、减少跟踪光线对医生的束缚、解决因跟踪光线遮挡问题带来的手术风险等效果。