本发明公开了一种甲醇和轻烃联合芳构化与制氢生产系统及方法，涉及石化技术领域，该生产系统包括：依次管道连接设置的轻烃进料线、轻烃缓冲罐、轻烃泵、原料预热器管程、原料加热炉、芳构化反应器、原料预热器壳程、冷却器、三相分液罐、富气压缩机、吸收稳定系统、原料气分液罐、原料气压缩机、原料气预热炉、高温蒸汽转化炉、转化气蒸汽发生器、中温变换反应器、热能回收系统、PSA氢提浓系统和高纯氢气出管线；本发明将甲醇和轻烃联合芳构化与制氢，将甲醇、轻烃组分和干气共转化，实现热能耦合，节约能源消耗，所产的干气和液化气制氢，经过芳构化反应实现原料气净化，可取消甲醇制氢装置和干气制氢干气预处理，节约设备投资。