本发明提出了一种防水环保型架空隔热层结构及其施工方法，架空隔热层结构包括隔热板和支撑框架，隔热板的顶部设置有种植槽，支撑框架包括与屋体侧壁数量相对应的矩形框架，矩形框架内设置有储水板和活动板，储水板与矩形框架固定连接，活动板与矩形框架滑动连接，矩形框架内设置有第一驱动装置，第一驱动装置驱动活动板与储水板重叠或展开，储水板内开设有储水腔，储水腔与种植槽之间连通有储水管和洒水管，洒水管上设置有抽水泵；施工方法包括：对屋面进行坡度修整；安装支撑框架；安装隔热板；连通种植槽和储水腔；通过第一驱动装置驱动活动板活动，使活动板与矩形框架之间形成通风口，或将矩形框架封堵，实现屋内通风和保温隔热。