本发明属于畜牧兽医检验技术领域，尤其是一种畜牧兽医检验用载玻片批量化清洁消毒系统，现提出如下方案，包括底板，所述底板顶部固接有环形结构的防护板、固接在防护板顶部的顶盖板、以及固接在顶盖板顶部的上料组件、与防护板内圈活动套接的清洗消毒组件、以及与清洗消毒组件连接的旋转机构。本发明实现了载玻片的大批量上料、连续清洗消毒、干燥和下料操作，在清洗消毒和干燥的过程中利用水流和气流的动力进行输送以及清洗干燥操作，简化设备结构，提高清洗效率，降低检验人员清洗载玻片的难度，方便检验人员使用载玻片进行检验操作。