本发明公开了一种不同收入方式混合计算个税的方法，包括以下步骤：获取员工的个人信息及收入信息；采集员工当月税前收入并根据员工个人信息登录社会保险系统采集员工保险信息，进行正向计算个税，并记录所有员工的当月累计应发、累计实发以及员工累计个税和当月个税数据；采集员工现金收入，同工资发放的累计收入汇总，反向计算个税，得出员工个人当月应交个税的报表；根据个税报表和员工个人信息和工资信息为员工代发扣税后的工资。通过本系统两个方式的计算，将人力资源部门发放工资与财务发放奖金两种方式有效的结合起来，即保证了数据的准确性，提高了工作效率，解决了人资部门和财务部门因不同发放方式的困扰，提高了工作效率。