本发明属于饲料消毒技术领域，尤其是一种用于饲料制造系统的消毒设备及其消毒方法，针对臭氧进行消毒时，臭氧气泡较大导致臭氧不能与饲料充分的接触，消毒效果差，饲料的消毒不彻底的问题，现提出以下方案，包括底座和消毒箱，所述消毒箱通过螺栓固定于底座的顶部外壁，所述消毒箱的底部外壁通过螺钉固定有电机，所述电机的一侧外壁设置有减速机，且电机的输出轴顶端通过螺钉固定有转轴，所述转轴的外壁通过螺钉固定有送料板。本发明通过设置的横轴、扰动板、弹簧一、细轴一、弹簧二和细轴二配合联动使得扰动板产生局部的摆动，可以将上升的臭氧气泡进行有效的破碎，使得臭氧与饲料充分的接触，提升消毒效果。