本发明研制出了一种用于HPV感染的中药棉栓及其制备方法和应用，涉及中药技术领域。一种用于HPV感染的中药棉栓，包括医用棉栓和浸渗于医用棉栓内的抗病毒中药液；制备方法为：称取黄柏、苦参、板蓝根、野菊花、金银花、蒲公英、紫花地丁、天葵子、半枝莲、连翘、地肤子、白鲜皮、白花蛇舌草、紫草、蛇床子、败酱草、石榴皮、百部和生甘草，进行清洗、烘干和切段，得到中药原料段；加水进行煎煮，将煎煮液过滤，再进行灭菌，得到抗病毒中药液；将抗病毒中药液和棉栓进行充分浸润，得到中药棉栓。本发明中药棉栓可以作用于宫颈局部，在使用过程中，药物逐渐释放，可以使作用时间更长，能极大提高中药的局部吸收，达到抗病毒杀菌的效用最大化。