本申请实施例提供了一种医疗数据ETL任务中的数据核查方法及装置，包括：在配置医疗数据ETL任务的任务流程过程中，确定至少一个需要进行数据核查的目标数据抽取组件；对于每一目标数据抽取组件，在该目标数据抽取组件之后添加数据核查点标志；执行医疗数据ETL任务的任务流程，在执行完每一目标数据抽取组件之后，基于该数据抽取组件对应的数据核查配置信息对该数据抽取组件进行数据核查得到核查结果。该方案在确定需要进行数据核查的数据抽取组件时，在配置任务流程的过程中对各数据抽取组件进行数据核查，节约了核查时间，提高了核查效率，考虑了各数据抽取组件的业务类型和所需处理的数据量，数据核查的适用性更强，且映射关系调整的难度更低。