本发明公开一种基于多频率特征电流信号的户变拓扑关系识别方法，涉及智能电表技术领域，解决了现有户变拓扑关系识别抗干扰能力较差，信道占用时间长，影响电力线载波通信的技术问题。该方法包括将多频率特征电流信号的不同频率映射为不同的N位二进制码，并将多个N位二进制码编码形成特征码位；主站向智能电表、终端设备发送户变拓扑关系识别命令；智能电表接收到户变拓扑关系识别命令后，在电力线上产生特征码位对应的特征电流信号；终端设备收到户变拓扑关系识别命令后，对电力线上的特征码位进行检测，并将检测结果发送至主站；主站根据检测结果确定智能电表的户变拓扑关系。本发明降低了对电力线载波通信的影响，也提高了抗干扰能力。