本发明公开的基于区块链的数据保护方法，包括步骤：S1、采集多源异构数据；S2、将采集的多源异构数据处理为具有指定格式的数据流，并从数据流中抽取开始时间、结束时间、业务类型，生成数据指纹；S3、将得到的开始时间、结束时间、业务类型和数据指纹拼装成报文；S4、将生成的报文存储在区块链上，原始数据仍然存储在本地数据库和/或本地文件中。将多源异构数据转化为仅包含开始时间、结束时间、业务类型和数据指纹的报文存储在区块链上，缓解了现有技术中需要将全部数据记录下来并逐一上链所造成的区块链的计算资源、存储资源和带宽资源开销过大的技术问题，还能够解决客户与证券公司的交互数据易删除、易篡改、无法确保数据的安全性和完备性的问题。