本发明公开了一种生物发酵空气多级过滤除菌设备，包括壳体，所述壳体的上端设置有进风槽，所述壳体内由上而下依次设置有杀菌腔和除湿腔，所述壳体的上端对称设置有两个放置槽，所述壳体内对称设置有两个鼓气腔，每个所述鼓气腔和与其相近的放置槽相配合；所述壳体内设置有通风机构，所述通风机构包括包括安装在壳体右侧的抽风机，所述抽风机的进风端延伸至除湿腔的内底部，所述杀菌腔内安装有蛇形管，所述蛇形管的出气端与除湿腔的内顶部连通。该设备在使用的过程中，可以很方便的就能实现过滤尘网的清洁，方便使用人员的使用，且还设置有警示器，可以在除湿材料吸水过多时，对使用人员进行警示，保证设备整体的除湿效果。