本发明公开一种用于高压灭菌柜的凝结水节能排放设备及方法，该设备具有第一凝结水排放装置、第二凝结水排放装置、换热器及控制器，第一凝结水排放装置用于将与高压灭菌柜相连的进汽管内的凝结水导入换热器，第二凝结水排放装置用于将高压灭菌柜内的凝结水导入换热器中，当温度探头检测到换热器内的温度达到第一温度阈值时，则开启第一进水管上的第一进水阀，利用第一进水管中的冷却介质对换热器中的凝结水进行冷却。本发明将高压灭菌柜内部以及进汽管道内的凝结水引入换热器进行降温，能够保持高压灭菌柜干燥，并且，利用真空泵排出的冷却水对换热器内的凝结水进行降温，换热器排出的水经自来水进一步降温后，可以再次利用。