本申请实施例提供一种水底地表基质取样器，涉及水底地表基质领域。水底地表基质取样器包括：连接器组件和取样器组件。所述连接器组件包括取样器安装件、辅助设备连接件、固定轴和连接法兰，所述第一定位卡块插入所述取样器组件内壁，所述取样器组件顶端固定连接于所述固定法兰。当需要连接取样器组件时，将旋挖机的钻杆端部插入连接槽内，使用固定轴依次穿过辅助设备连接器和旋挖机的钻杆，进而将辅助设备连接器固定于旋挖机的钻杆，第一定位卡块插入取样器组件，将取样器组件和固定法兰相互通过螺栓固定，进而便于将取样器组件和旋挖机连接，连接简单，可利用旋挖机等辅助设备进行取样。