本发明公开了西瓜种子清洗分选设备，属于种子分选技术领域，包括清洗箱，清洗箱的一端上设有载板，载板的顶部安装有第三支架、抽水泵和气泵，抽水泵上连接有进水管，气泵的输出端连接有气管，气管上开设有多个出气嘴，气管的一侧设有齿槽，清洗箱上活动安装有清洗篮，清洗篮的上方设有安装在清洗箱上的滤料袋，清洗箱的另一端上设有出水管，清洗箱的两侧均设有驱动箱。本发明相对于传统的清洗方式，通过移动的清洗篮能够通过水流对种子进行清洗，且通过齿轮能够在清洗篮移动的过程中，通过齿轮与齿槽啮合，然后带动搅拌轴转动，对种子进行高效的清洗，整体的筛选效率高，能够有效地增加种子筛分的效率。