本发明涉及微生物过滤消毒技术领域，且公开了一种实验室用微生物过滤装置及其过滤方法，所述储水筒的顶部固定连接有入料口，所述固定底板顶部的另一侧固定连接有过滤舱，所述过滤舱一侧的底部固定连接有排水管，本发明通过设有固定底板，有利于起到固定整体装置的作用，通过设有水桶支架，有利于起到固定连接有储水筒的作用，通过设有入料口，有利于水源的加入，通过设有过滤舱，有利于起到固定过滤装置的作用，通过设有排水管，有利于起到排水作业的作用，通过设有传送U型管、连接管、伸缩水管，有利于水源的传动，通过设有微型水泵，有利于水源动力传动力，通过设有喷水枪口，有利于水源的传送喷洒。