本发明公开了一种纳米催化自由基浒苔污染治理方法，具体包括如下步骤：S1、采用抽水泵抽取待治理水体的海水，抽水泵的出水端分为两支，其中一支与纳米催化自由基装置的进水端相连，另外一支与快速混合装置的进水端相连；S2、将纳米催化自由基装置的出水端与快速混合装置的进水端相连，通过纳米催化自由基装置催化产生自由基并将自由基添加到海水中；S3、在待治理水体中设置含有出水孔的环形管网，并将快速混合装置的出水端与环形管网相连，通过环形管网将含有自由基的海水均匀散布到待治理水体中，通过自由基消除海水中的浒苔，使海水中叶绿素浓度保持在0.02μg/L以下；该发明充分利用自由基强氧化性的特性，达到净化水体，抑制浒苔爆发污染的目的。