本发明公开了一种盆栽蔬菜的根系取样装置，包括：行走机构；土壤分离机构，所述土壤分离机构包括敲击部件、盆体和第一驱动装置，所述盆体包括底盘、第一壳体和第二壳体；所述第一驱动装置能驱动所述第一壳体与所述第二壳体相对所述底盘合并或分离，以围成或拆分所述盆体；所述敲击部件设置多个，多个所述敲击部件围绕所述盆体设置，所述敲击部件包括固定端和活动端，所述活动端能相对所述固定端伸缩，所述敲击部件的活动端正对所述盆体设置；夹持机构，所述行走机构用于驱动所述夹持机构移动至所述土壤分离机构处，所述夹持机构用于夹持所述盆体处的蔬菜，通过可开合的盆体和敲击部件的配合，能较大程度地保持根系的完整性。