本发明涉及一种用于生物材料玻璃化的自动化处理设备,包括:机架；处理件，设于机架上，处理件包括本体及开启阀，本体开设有第一容腔及第二容腔，第一容腔与第二容腔之间通过第一通道连通，且第一通道仅允许液体通过，本体内设有与第二容腔及外界连通的第二通道，开启阀可拆卸地设于第二通道内，且开启阀能够将第二通道密封；移动载体，可移动地设于机架上；注液装置，设于移动载体上，注液装置随移动载体的带动能够向第一容腔内注液或者吸液；以及第一取料件，设于移动载体上，第一取料件随移动载体的带动能够将开启阀由所述第二通道内取出。这种自动化处理设备能够稳定地对生物材料冷冻预处理及转移，实现标准自动化操作。