本发明涉及益生菌筛选领域，具体的说是所述一种抑幽门螺旋杆菌用益生菌筛选器，包括恒温水箱、培养机构、驱动机构、连通机构、压缩机构、限位机构和取样机构，当需要取出样本时，将注射器与取样机构连接，挤压注射器，使氮气进入取样机构的内部将取样机构内部的培养液挤出，同时氮气带动取样机构在培养液的底端转动，搅动使取样机构底端的培养液的幽门螺旋杆菌和益生菌，使取样机构底端的幽门螺旋杆菌和益生菌均分分布在培养液中，且取样机构只搅拌培养机构底端的培养液，培养机构中的培养液运动幅度小，避免培养液中的幽门螺旋杆菌和益生菌菌落受到损伤，抽取注射器，将样本从培养机构的内部取出即可，提高检测结果的准确性。