本发明公开了一种微量液体分配装置，包括反应池和压头部分；所述反应池内设有至少一个加样腔和微孔阵列区，所述微孔阵列区设有阵列区平台面和开设在所述阵列区平台面上的若干微孔；所述压头部分的表面设有密封面和凸出于所述密封面的凸台，所述凸台可填充至所述加样腔内，以使所述加样腔内的液体移动至所述微孔内，所述密封面可与所述微孔阵列区的阵列区平台面压紧以密封所述微孔。本发明所提供的微量液体分配装置，利用所述凸台和所述密封面的设置，实现对液体的分配和密封，避免了油相或其他试剂的引入，操作便捷，稳定性高。