本发明涉及数据存储技术领域，提供一种LDPC译码器的译码方法和系统，方法包括：在采用列分层最小和译码算法进行列更新时，根据当前迭代过程得到的当前列的变量节点传递给校验节点的信息中的最小值确定当前迭代过程中的真实最小值的近似估计值，真实最小值为所有列的变量节点传递给校验节点的信息全排序后得到的最小值；在进行当前迭代过程的列更新的同时，采用流水线的方式进入下一列更新的水平运算，在下一列更新过程采用所述近似估计值作为真实最小值计算校验节点传递给变量节点的信息。本发明能够在进行当前列的更新时根据近似估计值快速实现下一列的水平计算，方便硬件进行流水实现，从而大大降低延迟，提高带宽。