本发明公开了一种制药发酵罐及发酵控制系统，该制药发酵罐包括发酵罐体、第一加热机构、压力保持与换气机构、第二加热机构、冷却机构、控制模块，其结合多种加热方式和加热位置，并结合前述部件，实现了对发酵培养基全面且均衡的加热升温灭菌，尤其是结合改进的升温与控温步骤、由公式推导的有依据的理论灭菌时间，摒弃了现有不确定性的控制方式，能够同时实现对灭菌过程的粗调和微调，不仅获得了优异的灭菌效果，而且还降低了加热升温以及控温灭菌过程对发酵培养基的破坏，并且灭菌时间可以相应减少，对加热能源的需求降低，灭菌生产效率高，能够自动化控制，生产过程更安全，适用于作为发酵控制系统的一部分且用于发酵培养基的除菌。